全军进入黑水峪没多久，随着一股黑云笼罩峡谷上空，天上下起了小雨。高迎祥下令全速前进，生怕雨势加大，战马和车辆难行。
没过多久，刚才峡谷上空的乌云逐渐蔓延到整个天空，淅淅沥沥的小雨变成了瓢泼大雨。还算宽阔的山路变得泥泞不堪，绵延达二十余里长的队伍行进速度顿时慢了下来。
此时前锋已经行进了三十余里，想掉头回返已是很难，只能硬着头皮往前，只盼能早一点走出黑水峪。
到了晚上宿营时，数万人马只能在泥水中搭起帐篷，大雨已将树木浇透，想生火烧水也寻不到干燥的木头。幸亏流贼们带着早就蒸好的面饼，从路西侧的子午河中打来凉水，一口水一口饭的吃了起来。躺倒在潮湿的地面睡觉之前，很多人都想着，明天睁开眼，天就放晴了。
谁知道第二天早上醒来，大雨还是继续下个不停，并且丝毫没有减弱的趋势。
在大小头领们的呵斥声中，流贼们不得不一边大骂一边前行。
走到第四天，闯营断粮了。
虽然打破了三处县城后抢了不少粮食，但同时也有更多的流民或被逼或自愿的加入进来。原先只有一万多人的流贼队伍，迅速扩充到三万多，整整翻了一倍。一下多出这么多张嘴吃饭，就等于最近抢来的粮食白抢了。
高迎祥本以为三日就能走出黑水峪，然后直接打下兴平县，马上就又会有了粮食，可这都已经第四天了，还没走出黑水峪。
他想派人去催促前锋加快行军速度，可前路上士卒车辆将道路堵得水泄不通，一来一回的时间说不定就走出去了。
高迎祥让人把仅有的数百袋干饼运到中军老营这边，然后下令把被雨淋的已经发霉的干饼分发给带队的头领，并告诉他们每人一顿只能吃半个干饼。这数千老营士卒是他的根基所在，饿着谁也不能饿着他们，其他人的死活他根本不去关心。
两千余匹战马也倒下近半，本来可以宰杀吃肉，但那里去找干柴呢？高迎祥只能忍痛放弃。其余的战马也都掉膘严重，短时期内根本无法骑用，只能牵着前行。
饿着肚子的流贼们只能继续前行。高迎祥派人到处宣告，明日就能出黑水峪，然后打破县城，大家想吃啥敞开吃就成。
这一条果然奏效，士卒们本来渐升的怨气迅速平息下去，每个人都在进了城先持盾饱饭再说。
第五日过天星派人传信马上走出黑水峪时，高迎祥因为内大雨淋湿而感染风寒，躺倒在担架上。
不光是他，连续数日冒雨行军，数万人的队伍有一成染病，